Moldovaan kuuluva Gagauzian autonominen alue pyysi Moskovalta apua ja syytti Moldovan hallitusta ”russofobiasta”. Transnistrian konflikti ei ole ainoa ongelma Venäjän ja Moldovan välisissä suhteissa. Samankaltainen kehityskulku on käynnissä myös Moldovan koillisosassa sijaitsevalla Gagauzian autonomisella alueella. Gagauzia on Transnistrian tapaan erittäin Venäjä-mieleinen alue. Toisin kuin Transnistria, Gagauzia ei ole julistautunut itsenäiseksi.